در راستای استقرار نظام جامع نظارت، ارزیابی و تضمین کیفیت و به منظور ارتقای کیفیت نظام آموزش عالی در سال 1387 وزارت علوم، تحقیقات و فناوری با آیین نامه شماره 3081/17/23 اقدام به تصویب شیوه نامه و تشکیل هیات های نظارت وارزیابی دانشگاهها و موسسات آموزش عالی در هر استان نمود بنا بر این شیوه نامه در هر استان یک دانشگاه دولتی وابسته به وزارت علوم به منظور هدایت و راهبری فرایند نظارت و ارزیابی مؤسسه های آن استان انتخاب شد. بر این اساس دانشگاه قم به عنوان دانشگاه منتخب استان، فرآیند نظارت و ارزیابی بر دانشگاه ها و مؤسسات آموزش عالی استان را آغاز نموده است. در سال 1392 به دلایل غیر حرفه ای هیئت نظارت و ارزیابی استان قم به پردیس فارابی دانشگاه تهران منتقل گردید و پس از 6 سال و در بهمن سال 1398 بر اساس آئین نامه تشکیل هیئتهای نظارت و ارزیابی استانی این هیئت مجددا به دانشگاه جامع استان یعنی دانشگاه قم واگذار گردید در حال حاضر هیأت نظارت  ارزیابی و تضمین کیفیت آموزش عالی استان قم با ایجاد 5 کارگروه وظایف محوله را بر اساس قوانین تدوین شده بعهده دارد.